精密細長軸的自身密封也是會按照結構形式上直接的也是會被分為是接觸式與非接觸式進行密封。按照接觸形式上會被分為是軸承座分為徑向密封與軸向密封。非接觸式密封被分為是帶防塵蓋與橡膠密封圈兩種；按照精密細長軸上的密封圈的構造也是被分為單唇密封與雙唇密封。

精密細長軸的防塵蓋密封間隙上比較大，只適于防塵，橡轉盤軸承膠密封圈密封間隙上比較小，也是會有比較好的密封效果。對于橡膠密封圈唇來說，它會以一定的貼合力和精密細長軸軸承旋轉部位過盈進行接觸，這時候，也是會起到了比較好的防塵密封效果。不過要注意它的極限轉速上比較低與摩擦力矩上比較大。

精密細長軸的附加密封裝置能有效地防止外界異物入侵，但是對于這種附加密封裝置也是會增大機構上的軸向尺寸，會給使用與安裝維修帶來很大的不便，與此同時，對于它的密封性能也是會受到軸徑與殼體相配部位的加工精度與行位公差的影響。

但是對于帶密封的精密細長軸會有一個比較好的密封潤滑環境，又可以解決支承部位的難題；與此同時，其在很大的程度上也是能省去復雜的潤滑系統。 由于精密細長軸結構上比較緊湊，所以密封上要求比較嚴格的部位。

建議精密細長軸進行使用密封的自身密封除了具有比較好的防塵，密封效果，除此之外在運轉過程當中不補給潤滑劑而保持良好的運轉狀態，這樣精密細長軸在進行使用的時候，也是能減少了維修時候的費用。